Stephen Philip Jones (narodený 3. septembra 1955) sa narodil v Shepherd’s Bushv Londýne, kde vyrastal so svojou mladou matkou, ktorá pracovala ako kaderníčka, a so starými rodičmi. Najprv sa presťahoval na Benbow Road v Shepherd’s Bush a potom do Nine Elms v Battersea . Bol jedináčikom a jeho otec, Don Jarvis, profesionálny boxer, odišiel, keď mal dva roky. Vo svojej autobiografii z roku 2016 Lonely Boy odhalil, že ho sexuálne zneužíval jeho nevlastný otec Ron Dambagella, ktorý ho obviňoval z neskoršej sexuálnej závislosti a neschopnosti vytvárať trvalé vzťahy. Tiež odhalil, že bol negramotný až do štyridsiatky. Jones tvrdil, že Sex Pistols ho zachránili pred zločineckým životom.
Jones je gitarový samouk, ktorý v prvých rokoch hrával predovšetkým na elektrických gitarách Gibson Les Paul . Hral údajne iba tri mesiace pred prvým koncertom Sex Pistols. Jeho obvyklou gitarou bol krémový Gibson Les Paul Custom, ktorý Malcolm McLaren získal od Sylvaina Sylvaina z The New York Dolls .